Située dans le Phanar (Fener), à côté de la grande école grecque du quartier, cette église est dédiée à la Vierge, mais elle est connue sous le nom de Sainte-Marie des Mongols ou Mouchliotissa.
Selon la tradition, l’église fut fondée par la princesse Marie Paléologue à la fin du XIIIe siècle. Marie, fille de l’empereur Michel VIII Paléologue, fut mariée à un prince mongol et vécut à ses côtés pendant quinze ans. A l’assassinat de son mari, elle retourna à Constantinople et fonda ce monastère dédié à Mouchliotissa, la patronne des Mongols, et y passa le reste de sa vie en tant que nonne. Une mosaïque la représente à l'ancienne église Saint-Sauveur stin Chôra.
C’est un des seuls sanctuaires byzantins toujours en possession de la communauté grecque (romaine) depuis l’Empire.
La restauration récente de l’édifice a été particulièrement maladroite et la plupart des  peintures d’origine ont disparues. Par contre, on peut y voir de magnifiques icônes, dont une du XIe siècle représentant la Vierge.
La plupart des bâtiments qui entourent la cour de l’église, sont de l’époque byzantine, notamment l’ayazma (source sacrée). L’autre ayazma, à l’intérieur de l’église, est souterraine, mais ne fonctionne plus.