Au Concile d’Ephèse, le dogme de la Theotokos est rejeté par Nestorius, Patriarche de Constantinople (un calviniste avant l'heure). Il est déposé, mais une partie des chrétiens de l’Orient le suit dans sa protestation.
Il s’agit essentiellement de chrétiens «syro-araméens » vivant le long de la frontière de l’Euphrate et au-delà dans l’Empire parthe ou Sassanide. Ainsi se constitue une juridiction « non-romaine », dont le siège est à Séleucie-Ctésiphon en territoire Parthe (sassanide). C’est ce qu’on a appelé l’Ancienne Eglise de l’Orient ou « Eglise nestorienne » par référence à sa théologie ou encore « assyrienne » par référence à ses racines ethnico-linguistico-historiques. Cette Eglise assyro-nestorienne (ou syro-orientale) se répandra sur l’ensemble du continent asiatique, elle demeurera indépendante de toute juridiction romaine et confessera toujours une théologie nestorienne.
Ces « nestoriens » parlant le dialecte assyro-araméen oriental sont appelés parfois « assyriens », au sens religieux. Le qualificatif « Ancienne Eglise de l’Orient » que se donne à eux-mêmes ces « assyriens » ou « nestoriens » se dit en arabe « suryani kadim » c’est à dire « ancien syrien ou ancien syriaque », car pour les autres populations de l’Orient, les « assyriens ou nestoriens » ne peuvent pas monopoliser le qualificatif d’Eglise de l’Orient.
Aujourd'hui, le Catholicos de Séleucie-Ctésiphon (parfois dit de Babylone) réside aux Etats-Unis (!).

En Turquie, il n'existe plus d'Eglise organisée. Les nestoriens vivent dans les régions frontalières avec l'Iran et l'Iraq.

Autres Assyriens
Histoire du patriarcat d'Antioche